В интернете появилась база данных WikiPathways, содержащая информацию о биохимических путях организмов, организованная по принципу Википедии. На данный момент в WikiPathways представлены 549 путей для семи организмов: человек (Homo sapiens), серая крыса (Rattus norvegicus), мышь (Mus musculus), муха-дрозофила (Drosophila melanogaster), нематода (Caenorhabditis elegans), пекарские дрожжи (Saccharomyces cerevisiae) и рыба полосатый данио (Danio rerio).Группа биоинформатиков, создавшая базу данных WikiPathways, использовала стандартную программную часть Википедии и специально разработанные алгоритмы для "рисования" моделей биохимических путей. Поиск в WikiPathways можно вести по названию того или иного биохимического пути, названию гена или белка или ключевым словам.Как и в Википедии, зарегистрированные пользователи могут редактировать контент, добавлять к нему информацию или создавать новые страницы. Это не первый биоинформатический инструмент, созданный разработчиками WikiPathways. В 2001 году они создали программу Gene Map Annotator and Pathway Profiler (GenMAPP), которая позволяла вычленять основные направления в сложных биохимических путях. Программа активно использовалась, однако пользователи редко посылали созданные с использованием их данных схемы обратно. Поэтому было принято решение создать базу по принципу Википедии, которая предусматривает постоянное увеличение количества содержащейся информации самими пользователями.В последнее время формат Википедии стал очень популярен среди биоинформатиков. Так, несколько месяцев назад была создана база WikiGene, содержащая информацию о генах человека. Принцип Википедии используется также в базе Protein Data Bank Wiki - "хранилище" трехмерных структур молекул белков и нуклеиновых кислот) и еще нескольких менее популярных базах.
В интернете появилась база данных WikiPathways, содержащая информацию о биохимических путях организмов, организованная по принципу Википедии. На данный момент в WikiPathways представлены 549 путей для семи организмов: человек (Homo sapiens), серая крыса (Rattus norvegicus), мышь (Mus musculus), муха-дрозофила (Drosophila melanogaster), нематода (Caenorhabditis elegans), пекарские дрожжи (Saccharomyces cerevisiae) и рыба полосатый данио (Danio rerio).Группа биоинформатиков, создавшая базу данных WikiPathways, использовала стандартную программную часть Википедии и специально разработанные алгоритмы для "рисования" моделей биохимических путей. Поиск в WikiPathways можно вести по названию того или иного биохимического пути, названию гена или белка или ключевым словам.Как и в Википедии, зарегистрированные пользователи могут редактировать контент, добавлять к нему информацию или создавать новые страницы. Это не первый биоинформатический инструмент, созданный разработчиками WikiPathways. В 2001 году они создали программу Gene Map Annotator and Pathway Profiler (GenMAPP), которая позволяла вычленять основные направления в сложных биохимических путях. Программа активно использовалась, однако пользователи редко посылали созданные с использованием их данных схемы обратно. Поэтому было принято решение создать базу по принципу Википедии, которая предусматривает постоянное увеличение количества содержащейся информации самими пользователями.В последнее время формат Википедии стал очень популярен среди биоинформатиков. Так, несколько месяцев назад была создана база WikiGene, содержащая информацию о генах человека. Принцип Википедии используется также в базе Protein Data Bank Wiki - "хранилище" трехмерных структур молекул белков и нуклеиновых кислот) и еще нескольких менее популярных базах.